談台灣農業發展的問題，不能不先確定誰是農業發展的主角，否則主客易位，將政策實施的對象搞錯，就容易發生資源錯置、事倍功半以及時機喪失的問題。直覺上說，台灣農業發展的主角當然是農民，因為所有農產品都是由農民生產，沒有農民怎有農業；同時也因為農業發展良窳的後果，必須由農民自己直接來承受。
然而在台灣小農的耕作體制下，個別農家平均耕地面積僅在一公頃左右，無法達成規模經濟的生產，因此生產成本高，產品缺乏競爭力。此外近年來在農業勞動力快速老化之下，台灣農民的平均年齡已高達五十餘歲，在缺乏市場分析與應變能力之下，要這些高齡的農民去因應國內外市場的激烈競爭，承擔風險，恐怕也是不切實際。
因此，能擔當台灣農業發展主要角色的應是台灣的農民組織，如農會、產銷合作社等，因為在小農耕作體制下，唯有透過組織才能整合眾多小農，克服其在農業研發、生產因素採購、生產作業執行、以及農產品產銷上的資訊缺乏與規模劣勢。然而過去農會等農民組織在配合政府發展農業上多是擔任配角的角色，例如協助農業政策執行、替農民爭取福利，甚或本身成為代表農民政治利益的團體；而對其自身組織或事業的經營，卻缺乏效率的自我認知與要求。
因此今日若要這些農民組織成為台灣農業發展的主角，帶領台灣農民因應新WTO時代的全球化競爭，除有非我莫屬的自覺外，農民組織的自身的體質必須脫胎換骨，講求經營效率。大家所熟知的紐西蘭奇異果，其背後的經營主體即是該國的農業合作社，它的組織、發展以及成功的轉型為跨國性經營組織的故事，應可做為台灣農民組織改造的借鏡。
加入WTO後，從事農產品生產、加工、運輸、儲藏、國際貿易的各種農企業，應該也是台灣農業發展的主角之一，因其具有講究經營效率的企業本質，在今天農業就是商業的全球化競爭中，有其特別的優勢。最近商業週刊「一間公司，幹掉一個王國」的封面故事裡，幾年內打敗自詡為「蝴蝶蘭」王國台灣的，就是荷蘭的一家農企業，就是一個很好的例子。
然而台灣的農企業在過去並未曾得到政府大力的輔導與支持，原因是政府僅考慮其經營的目的在爭取其自身的商業利益，與增進農民利益的政策目標並不一致，也未重視其講究效率經營的組織面優勢。換言之，囿於上述的成見，政府在這幾年並未能因應WTO的新局面，積極有效地扶持台灣的農企業，擴大其規模，加速其成長，達成組織農民、開拓市場、效率產銷、以及國際化經營的目標。其實農企業與農民利益的整合在政府的支持與輔導下應非難事，過去欠缺的，應只是主政者的認知。
政府當然是台灣農業發展的另一主角，因為擁有數百億直接用於農業發展的預算以及高素質的研究團隊與公務人員，政府理應能協助農民並主導台灣的農業發展。然而在○二年加入WTO後，台灣農業面臨的是個全新的全球化的競爭環境，在此環境下，市場競爭的激烈與企業經營的複雜程度，以及對規模經濟與快速應變能力的需求，卻遠非政府機構所能處理、所能滿足。
因此在今後WTO時代裡，政府必須揚棄過去權威性主導心態，凡事自己領軍、衝鋒向前。換言之，在新的尊重市場機制的要求下，政府對農業發展角色應侷限在市場交易秩序維護、農民組織或農企業發展所需協助的充分提供、及代表國家對外進行貿易談判等；其他的經營實務則應由農民組織與農企業自行決策，負責成敗，而不是將自己視為農民或農企業的代表，凡事越俎代庖。
有鑑於此，今後台灣的農業發展策略應以輔導農民組織與農企業的發展為重點，增強其競爭力，讓其擔任農業發展的主角，領導農民，整合農產品的生產、加工、運輸、銷售、國際貿易等各種產銷活動。在此認知之下，大力輔導農民組織企業化經營、積極鼓勵農民組織整合或其供銷業務合併、或共同投資組建產銷企業、主動輔導農民組織與農企業建立合作關係（例如農企業外銷農產品的契作生產）、充分提供農民組織或農企業擴大經營規模所需長期低利資金、專業輔導農企業建立跨國經營能力等，都是未來值得政府最優先推動的重點工作。
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